Молекулярная динамика — это численное моделирование движения атомов в молекулярных
системах. Прогнозирование биологической активности с применением данного метода
является высокоточной альтернативой молекулярному докингу.

• Учет подвижности всех атомов системы.
• Непосредственное моделирование молекул растворителя.
• Учет возможности проникновения лиганда в полость сайта
  связывания.
• Возможность определения длительности связывания лиганда.
• Возможность моделирования связывания крупных лигандов, таких
  как, например, пептиды и полисахариды.
• Возможность изучения
  процесса активации рецептора позволяет отличить ингибиторы от активаторов.