Лаборатория вычислительных методов в медицине и фармации основана на базе Пятигорского медико-фармацевтического института для осуществления фундаментальных и прикладных исследований в области медицины, фармации и прикладной химии. Применяемые в лаборатории вычислительные методы позволяют раскрывать механизмы биологических и химических явлений, обобщать и структурировать данные эксперимента, прогнозировать свойства и поведение исследуемых систем.
В лаборатории ведется разработка программы Биоэврика для моделирования молекулярной динамики с использованием высокопроизводительных вычислительных систем на основе массового параллелизма. Разрабатываемая программа в настоящее время применяется для прогнозирования биологической активности, моделирования процессов жидкостной экстракции, фазовых переходов (плавление, кипение, растворение), изучения поверхностных явлений (адсорбция, поверхностное натяжение) методом молекулярной динамики.
Основные направления научной работы:
Прогнозирование биологической активности веществ
Моделирование жидкостной экстракции
Прогнозирование физических и физико-химических свойств веществ
- Термодинамические свойства (теплоты образования, теплоты сгорания, энтропия, теплоемкость и др.)
- Реакционная способность
- Устойчивость к деструкции
Моделирование химических реакций
- Определение термодинамических свойств химических реакций (тепловой эффект, возможность самопроизводльного протекания)
- Определение кинетических свойств химических реакций (порядок, энергия активации, константа скорости)
Геоботаника
- Сбор и привязка к картам геоботанической информации
- Создание баз данных геоботанической информации
Проведение циклов научных семинаров для студентов и молодых ученых
- Проведение циклов научных семинаров «Компьютерное конструирование лекарств»
- Проведение циклов семинаров «Основы программирования на языке C++»
- Проведение циклов научных семинаров «Разработка прикладных компьютерных программ для вычислительной химии и биоинформатики»
Разработка учебных пособий по темам
- «Компьютерное конструирование лекарств»
- «Разработка прикладных компьютерных программ для вычислительной химии и биоинформатики»
Разработка программного обеспечения
- Программное обеспечение для вычислительной химии
- Программное обеспечение для качественного и
количественного анализа - Программное обеспечение для геоботаники
- Программное обеспечение для ресурсоведения
- Программное обеспечение для биохимии
- Программное обеспечение для анализа результатов
микросъемки - Программное обеспечение для медико-биологической
статистики - Программное обеспечение для классификации
лекарственных растений, лекарственного растительного сырья, лекарственных
препаратов и др. объектов медицины и фармации - Программное обеспечение для автоматизации анализа
научных текстов - Программное
обеспечение для автоматизации вычислений
Разработка баз данных химической, биологической, геоботанической и других видов информации
Поиск веществ по структурным требованиям в базах данных поставщиков